Uno de los espacios protegidos más importantes de Cozumel es Chankanaab, el Parque Nacional de Chankanaab y su laguna son uno de esos espacios naturales que vale la pena visitar, se ubica al sur, y es una laguna que se comunica mediante túneles subterráneos con el mar. Esta laguna es uno de los acuarios naturales más importantes del mundo. Aquí podemos encontrar la estatua de la Virgen del Mar.