La naturaleza de Cozumel es amplia y variada, y en ella destaca de manera importante la fauna marina y la vegetación. La fauna terrestre y las aves también destacan en este pequeño paraíso caribeño.

En Cozumel, dentro de su flora, debemos destacar especies como el mapache enano, o el pizote, la lagartija… Pero sobretodo debemos destacar espacios protegidos como el Parque Nacional de Chankanaab, o el Parque Nacional Arrecifes de Cozumel, protegido desde 1996.

La flora y la fauna en este rincón caribeño son muy especiales, una flora y una fauna muy similar a la que podemos encontrar en otros puntos del caribe, los manglares en las zonas húmedas, los cedros o ébanos en las terrestres forman parte del paisaje de este lugar, donde también destacan plataneros, naranjos, caña de azúcar, etc…

Sobre su fauna, esta es más variada, si cabe, que la flora, con especies como tejones, mapaches, jabalíes… En Cozumel no existen especies felinas salvajes, si bien si podemos encontrar serpientes, pero no son venenosas, las especies más peligrosas las podemos encontrar en zonas pantanosas, especies como la boa, o el cocodrilo.

También debemos destacar una amplia variedad de aves en esta isla, aves como las golondrinas, un símbolo en Cozumel, las garzas, los tordos, las palomas, las tórtolas, los flamencos….

En los meses de verano se ve un espectáculo increíble, las tortugas que llegan hasta estas playas a desovar.